极少急性发病，多数起病缓慢，病程较长，常反复发作，间以长短不定的缓解期，亦称为慢性非特异性溃疡性结肠炎。早期可出现腹痛、腹泻和血便。主要累及直肠、乙状结肠和降结肠，病理特征为粘膜充血、水肿、多发性浅表溃疡，晚期肠壁增厚、肠腔狭窄并伴有息肉形成。临床上以顽固性腹泻、粘液便、血便或脓血便、腹痛和里急后重为特点，并可伴有发热、贫血、关节炎、皮肤病变和肝病等肠外表现。由于结肠肌肉痉挛、结肠膨胀和炎症刺激局部感觉神经，引起不同程度的腹痛。腹胀多局限于左下腹或下腹部，呈阵发性的轻度疼痛。当病变严重时可呈现绞痛。

主要症状：
　　腹泻或便秘， 病初症状较轻，粪便表面有黏液，以后便次增多，重者每天排便10～30次，粪中常混有脓血和黏液，可呈糊状软便。便血是较常见的症状，主要由于结肠黏膜局部缺血及溶解纤维蛋白的活力增加所致。一般为小量便血，重者可呈大量便血或血水样便。腹痛多局限左下腹或下腹部，轻症者亦可无腹痛，随病情发展腹痛加剧， 排便后可缓解。里急后重系由于炎症刺激直肠所致，并常有骶部不适。消化不良时常表现厌食、饱胀、嗳气、上腹不适、恶心、呕吐等。全身表现多见于急性暴发型重症患者，出现发热、水电解质失衡、维生素、蛋白质丢失、贫血、体重下降等。
体征：
　　左下腹或全腹压痛，可扪及降结肠特别是乙状结肠呈硬管状，并有压痛，有时腹肌紧张，肛诊可发现肛门括约肌痉挛，指套有黏液或血性黏液分泌物，直肠有触痛。有者可触到肝大，此与脂肪肝有关。
　　鉴别诊断：
　　①慢性细菌性痢疾
　　常有急性菌痢病史，粪便培养可分离出痢疾杆菌，结肠镜检查时取粘液脓性分泌物培养的阳性率较高，抗菌药物治疗有效。
　　②慢性阿米巴痢疾
　　病变主要侵犯右侧结肠，也可以累及左侧结肠，结肠溃疡较深，边缘潜行，溃疡间的粘膜多属正常。粪便检查可找到溶组织内阿米巴滋养体或包囊，通过结肠镜取溃疡渗出物作肠检更易找到阿米巴滋养体。抗阿米巴治疗有效。
　　③结肠癌
　　多见于中年以上，常经直肠指检查可触及肿块，结肠镜与X线钡剂灌肠检查对鉴别诊断有价值，须注意与溃疡性结肠炎引起的结肠癌变区别。
　　④血吸虫病
　　有疫水接触史，常有肝脾肿大，粪便检查可发现血吸虫卵，孵化毛蚴阳性，直肠镜检查在急性期可见粘膜黄褐色颗粒，活检粘膜压片或组织病理检查发现血吸虫卵。
　　⑤肠易激综合症
　　伴有全身神经官能症，粪便有粘液但无脓血，显微镜检仅见少数白细胞，结肠镜检查无器质性病变证据。
　　⑥其他
　　肠结核、缺血性结肠炎、伪膜性肠炎、难辨梭菌性肠炎、放射性肠炎、结肠息肉病、结肠憩室炎等应和本病相鉴别。