卵巢巧克力囊肿有可能会影响女性月经的。如果卵巢巧克力囊肿比较小，对月经的影响则不明显；如果是比较大的囊肿，则会对卵巢组织破坏的比较多，就会表现为月经的异常，临床上通常会引起月经量特别多。它会影响女性的卵巢功能，由于部分女性会表现为经期延长，而且女性卵巢功能受到影响会影响女性的排卵，甚至引起月经经期的延长。在临床上，对于卵巢巧克力囊肿这样的患者，应该定期进行超声检查，以排除巧克力囊肿迅速的长大，必要时则需要进行手术治疗。

子宫肌瘤又称之为子宫平滑肌瘤，是长在子宫体上的，一般分为浆膜下子宫肌瘤，粘膜下子宫肌瘤和肌壁间子宫肌瘤。大多数的子宫肌瘤是不会发生癌变的。随着女性闭经后，卵巢功能萎缩，雌孕激素分泌减少，从而会导致子宫的萎缩，肌瘤也会变小，甚至萎缩消失。巧克力囊肿属于子宫内膜异位症的一个表现，在临床上又称之为卵巢子宫内膜移位症。它两个长的部位是不一样的，所以是有一定区别的。在临床上用于过大的巧克力囊肿，是需要进行手术治疗的。

巧克力囊肿在发病早期时，有一部分患者是没有明显症状的。由于卵巢巧克力囊肿位于盆腔的深部，在有一部分患者早期实是没有症状的；有一部分患者在发病的早期会出现下腹部的疼痛，经期疼痛明显，而且这种疼痛有时会下会阴部、肛门、大腿等部位进行放射，经期疼痛的症状较为严重，甚至需要服用止痛药。一部分患者在性生活时，由于子宫的收缩上提会引发性交痛，甚至还会伴随点滴出血的症状，长时间性欲低下；一部分早期卵巢巧克力囊肿的患者会出现月经的异常，比如月经量增多，经期延长、月经淋漓不止者，不能及时调理，甚至还会出现贫血的现象。

巧克力囊肿不是必须手术治疗，巧克力囊肿是子宫内膜异位症的常见类型，跑出子宫腔的异位内膜在卵巢生长，形成囊肿。既然是内膜，即使不在子宫腔，它也会受到月经周期雌孕激素波动的影响，来一次月经，就长一点。然后脱落的内膜又不能像月经一样排出，只能呆在囊肿里，越积越多。这些陈旧性的出血，样子类似巧克力液，所以俗称巧克力囊肿，学名是“卵巢子宫内膜异位囊肿”。育龄期患者常合并不孕症，在不孕或有盆腔疼痛症状的妇女中发现率为20%-68%，临床上首先需对患者进行全面的不孕检查和生育评估，再结合病情的评分和生育指数，来给予生育指导。巧克力囊肿的治疗较为困难。总体原则是去除病灶、减轻疼痛、改善和促进生育、减少和避免复发。一般认为，对首次发现的巧克力囊肿直径≧4cm，可考虑手术治疗，首选腹腔镜下囊肿剔除术。但手术后极易复发，复发率为6%-67%。术后2年复发率为百分之二十一点五，术后5年高达4%-50%。

对于巧克力囊肿的患者饮食上不要过量的吃含有激素的东西以及含有大量雌激素的保健品。巧克力囊肿跟激素有一定的关系。在饮食时，要考虑所选择的食物有没有激素，比如豆浆对身体很好，但是吃很浓的豆浆也许就有影响了。如果吃胶原蛋白、蜂蜜或花粉类食物都不能量大，因为一旦量大，激素过量，对巧克力囊肿都是不利。另外，有一些不正规的保健品它会含有大量的雌激素，吃完以后可以感觉身体状态非常好，但实际上长期的大量的摄入，这些含有雌激素的保健品，有可能会促进或者导致卵巢巧克力囊肿的一个复发。而对于卵巢巧克力囊肿术后的病人的饮食并没有特别的禁忌，但是在手术后的一段时间病人要注意休息，适当的增加营养。