吃感冒药三天内不能打疫苗的原因是体内没有完全吸收和代谢药物成分，若接种疫苗，可能会影响接种效果，产生不良反应。
疫苗接种期间，应避免服用抗病毒的药物、激素类药物、免疫抑制剂等，否则会影响疫苗的接种效果。
不少感冒药具有抗病毒、清热解毒的作用，通常在服药后，经48小时左右药物成分才能完全吸收。如药物在体内吸收不完全时就接种疫苗，可能会降低药效，不但影响治感冒的效果，还会影响疫苗在体内形成抗体浓度，降低对病毒的抵御作用。
接种了疫苗后通常会有发烧、浑身无力等不良反应，用药后马上接种疫苗，可能使不良反应加重。另外，如患者刚服用感冒药，还存在发烧症状时，也应暂缓接种疫苗，否则也会使接种疫苗的不良反应加重，并影响疫苗的接种效果。