无论是未婚女性还是已婚女性都能做HPV检查，但提取标本的方法略有不同。一般未婚女性做HPV检查时，会将小毛刷通过处女膜的开口缓慢放入阴道内九厘米左右的部位，轻轻旋转数圈，刷取宫颈管内的分泌物和脱落的细胞当做标本进行检查，不会对宫颈部位造成损伤。因宫颈处主要受植物神经管理和支配，存在的神经纤维末梢很少，在提取标本过程中动作轻柔，通常不会有疼痛感。

已婚女性进行HPV检查时，会用窥阴器将阴道扩开，再用小毛刷在宫颈内刷取7-8圈，提取标本进行检测。这种检查同样不会使检查者有疼痛感。不过用窥阴器扩开阴道时，虽然无创伤，但也可能有轻微不适感，因持续时间较短，再加上这种不适感大多数人都可耐受，所以无需过于担心。