头孢曲松钠常见的 副作用一般和用量有关，静脉用药后，局部反应有 静脉炎，可通过减慢静脉注射速度（2-4分钟）以减少此现象发生。肌肉注射时，如不加用利多卡因会导致疼痛。此外可有皮疹、瘙痒、发热、 支气管痉挛和血清病等过敏反应，头痛或头晕，腹泻、恶心、呕吐、腹痛、结肠炎、黄疸、胀气、味觉障碍和消化不良等消化道反应。实验室检查异常，其中血液学检查异常占14％，包括嗜酸性粒细胞增多，血小板增多或减少和白细胞减少。肝肾功能异常。