广东治疗功能性胃肠病比较好的二甲医院包括南方医科大学南方医院、中山大学附属第一医院、中山大学附属第三医院、中山大学孙逸仙纪念医院、广州医科大学附属第一医院.榜单医院是博禾医院库基于复旦医院排行榜、省市卫健委、卫生部以及医院等级评级和当地影响力综合产生。南方医科大学南方医院是全国病理科医院排行榜第6位、中山大学附属第一医院是全国病理科医院排行榜第10位、中山大学附属第三医院是全国康复医学科医院排行榜第8位、中山大学孙逸仙纪念医院是全国泌尿外科医院排行榜第4位、广州医科大学附属第一医院是全国变态反应科医院排行榜第4位。
全国病理科医院排行榜第6名:南方医院系南方医科大学（原第一军医大学）第一附属医院、第一临床医学院，是一所集医疗、教学、科研和预防保健为一体的大型综合性三级甲等医院，全国百佳医院。医院创建于1941年。
全国病理科医院排行榜第10名:中山大学附属第一医院（简称“中山一院”）始建于1910年，秉承“医病医身医心、救人救国救世”的医训精神，中山一院现已发展为一家位于国内一流前列的现代化三级甲等综合性医院。
全国康复医学科医院排行榜第8名:中山大学附属第三医院（原中山医科大学附属第三医院），是国家卫健委直管的综合性三级甲等医院。先后荣获国家爱婴医院、广东省文明医院，2018年12月，获批准为广东省高水平医院第二批重点建设医院。
全国泌尿外科医院排行榜第4名:山大学孙逸仙纪念医院（中山大学附属第二医院）为国家卫生健康委属（管）医院，创建于1835年，是我国第一家西医医院，已成为一所集医疗、教学、科研和预防保健为一体的大型综合性三级甲等医院。
全国变态反应科医院排行榜第4名:广州医科大学附属第一医院是一所集医疗、教学、科研、保健、康复、院前急救于一体的大型三级甲等医院，也是广州呼吸kaiyun全站网页版登陆研究所、也是国家首批13个国家临床医学研究中心之一。
