孩子半夜腿疼的原因，主要有以下几个方面：1.生长痛导致。生长痛是孩子快速发育期间，比较容易出现的一种生理性疼痛。因为骨骼发育比较快速导致牵拉痛，或者代谢的产物堆积在肌肉里面也会引起酸痛感。这是比较正常的生理现象，一般疼痛程度不是很剧烈。2.运动过量导致。特别是孩子白天进行体育活动的时候量比较大，导致肌肉的活动过度，一方面容易引起肌肉痉挛，所以晚上出现疼痛感。另一方面运动量过大会导致乳酸堆积在肌肉中，从而引起酸痛感。3.身体缺钙导致。当身体缺钙的时候会影响到骨骼的发育，同时也会引起肌肉部位出现痉挛的现象，从而导致半夜腿疼。
