广东深圳传染科二级医院排行榜排名靠前的医院有南方医科大学南方医院、深圳市第三人民医院、广州市胸科医院、中山大学附属第三医院、广州市第八人民医院,榜单医院是博禾医院库基于复旦医院排行榜、省市卫健委、卫生部以及医院等级评级和当地影响力综合产生。其中南方医科大学南方医院是全国传染感染医院排行榜第4位、深圳市第三人民医院是全国结核病医院排行榜第3位、广州市胸科医院是全国结核病医院排行榜第5位、中山大学附属第三医院是华南区传染感染科医院排行榜第2位、广州市第八人民医院是华南区传染感染科医院排行榜第5位。

全国传染感染医院排行榜第4名:南方医院系南方医科大学（原第一军医大学）第一附属医院、第一临床医学院，是一所集医疗、教学、科研和预防保健为一体的大型综合性三级甲等医院，全国百佳医院。医院创建于1941年。

全国结核病医院排行榜第3名:深圳市第三人民医院（原深圳市东湖医院)始建于1985年， 2010年10月医院整体搬迁至新院址—深圳市龙岗区布吉李朗，是由深圳市政府创办的一所大型现代化“强专科，大综合”的市属三级甲等医院。

全国结核病医院排行榜第5名:广州市胸科医院建于1953年，座落于广州市，现在业务用房面积40182平方米，绿树婆娑，环境幽雅，是广州市花园式单位。医院是中山医科大学、第一军医大学、广州医学院、暨南大学医学院等院校的教学基地。

华南区传染感染科医院排行榜第2名:中山大学附属第三医院（原中山医科大学附属第三医院），是国家卫健委直管的综合性三级甲等医院。先后荣获国家爱婴医院、广东省文明医院，2018年12月，获批准为广东省高水平医院第二批重点建设医院。

华南区传染感染科医院排行榜第5名:广州市第八人民医院是中山大学、南方医科大学、广州医学院、广东药学院等高等医学院校教学医院,是广州医学院非直属附属医院,也是广州市医保定点医院。医院拥有一支以优秀的临床专家为骨干的实力雄厚的专业队伍。