治疗咽炎的药物很多，包括 抗生素、去火润喉药、化痰止咳药，甚至要用到抗过敏药物等等。针对不同的咽炎要选择不同的治疗药物。
急性咽炎建议多喝水，可使用去火、止咳的这类的中成药，往往有比较好的效果。如果急性咽炎控制不好，合并细菌感染，病人会有明显咽痛、低烧，可能要配合抗生素辅助治疗。常用的如头孢类、青霉素类、大环内酯类、喹诺酮类等。
慢性咽炎往往不建议用抗生素，因为慢性咽炎大多数是因为物理、化学刺激导致的，更多的症状是咽干、异物感，所以不建议使用抗生素，多使用一些中成药，如清热解毒、润喉生津化痰的药物。