胆管结石内胆管结石通过需要做肝脏的部分切除，外胆管结石通过胆道切开取石，胆道镜探查方法能够来解决石头。
胆管结石分两大个内容，内胆管结石和肝外胆管结石，这两种方法是不一样的， 肝内胆管结石只在胆管的肝内的部分出现了石头，如果在汇合处的石头，可以通过切开探查取石的方法来进行适合的排除。
肝内 胆管结石的位置比较深，在三级胆管以上，这个时候就需要做肝脏的部分切除，就是把生病的胆管和部分的肝脏同时切除，做肝外肝脏切除的胆管结石有很严格的指征，需要看到肝脏有萎缩，肝胆胆管结石不可能通过排石的方法来排出，病人有症状比较明显，这个时候可以做部分的肝脏切除。
肝外胆管结石，目前常用的方法主要还是各取石，取石分两大个部分，开腹或者 腹腔镜下，通过胆道切开取石，胆道镜探查方法能够来解决石头，另外在胆管下端进入十二指肠或者 胰腺段的石头，从上面的胆道镜已经很难把这个石头取走了，可以通过做十二指肠镜和普通 胃镜类似的一种检查，从口腔食道进到胃，进到十二指肠，在十二层找到乳头，然后打开乳头，从乳头进入到胆总管去，这样也可以把胆管的石头能够取净。
除了手术治疗胆管结石，有一些泥沙样的石头，通过药物的可以促进胆石的排出，临床上常用的比如熊去氧胆酸，消炎利胆片，都能促进胆道里面泥沙上的石头顺利的排出，有一小部分病人也不需要通过手术了，所谓通过内科保守治疗，就是药物治疗也能达到排石的良好的目的。