卵巢巧克力囊肿属于子宫内膜异位症的一种是非常容易复发的，目前临床上治疗子宫内膜移位症的根本目的是缩减和去除病灶、减轻和控制疼痛、治疗和促进生育、预防和减少复发，那么她的治疗方法应该根据患者的年龄症状、病变部位、病变范围以及对生育的要求加以选则。目前临床上强调个体化的治疗，可以选择药物进行治疗，治疗的目的是抑制卵巢功能阻止内膜异位症的复发，这种治疗方式适用于有慢性盆腔痛、经期痛、疼痛症状比较明显，而且有生育要求，没有卵巢囊肿形成的患者对于较大的卵巢、子宫内膜异位囊肿，特别是卵巢内的囊肿的性质没有明确者，并应该采取手术治疗。

目前对于巧克力囊肿的确诊，首先要做妇科超声检查，因为卵巢巧克力囊肿和其他的囊肿有点不一样。卵巢巧克力囊肿的超声下的回声不是太均匀，因为里面包绕着像“巧克力状的东西”比较粘稠，而且巧克力囊肿的囊壁较厚，还会和周围形成粘连，所以应该做超声检查，必要时也可以做核磁共振和ct检查，但是对于巧克力囊肿的金诊标的诊断一定是腹腔镜。腹腔镜也相当于一个手术，在临床上除了做影像学的检查，还可以进行抽血检查。抽血查肿瘤标记C125，如果c125增高，考虑有可能是子宫内膜异位症，可能是巧克力囊肿。

卵巢巧克力囊肿又称为卵巢子宫内膜异位囊肿，主要症状是下腹痛、痛经、不孕及性交不适。不孕率高达40%。所以说怀孕几率大概是60%。引起不孕的原因复杂，如盆腔微环境改变影响精卵结合及运送，免疫功能异常导致抗子宫内膜抗体增加而破坏子宫内膜正常代谢及生理功能、卵巢功能异常导致排卵障碍和黄体形成不良等。此外，未破裂卵泡黄素化综合征在内异症患者中具有较高的发病率。中、重度粘连者可因卵巢、输卵管周围粘连而影响受精卵运输。如果巧克力囊肿直径大于4cm建议手术治疗。腹腔镜手术是首先的治疗方式。年轻、轻中度者，术后可期待自然妊娠6个月，对于年龄大于35岁，不孕年限超高3年，尤其是原发性不孕者，重度内异症、盆腔粘连、病灶切除不彻底者，输卵管不通者，应积极辅助生殖技术助孕。

卵巢巧克力囊肿患者要注意增加蛋白质的摄入量，还要适量食用蔬菜和水果，少吃油腻的食品以及各种滋补品，不宜吃温补的食品。1、增加蛋白质的摄入量，如鱼、肉、禽、蛋类，以增强抵抗力。2、食用适量的蔬菜和水果，以帮身体补充身体所需的矿物质和维生素，提高自身的抵抗力。3、少吃油腻的食物，因为吃多了不容易消化，还会导致体内脂肪堆积，影响内分泌水平，对病情不利。4、不宜吃温补的食物，卵巢囊肿的女性忌食温热活血的食物，比如羊肉、狗肉、韭菜、胡椒等。5、有些所谓的滋补类食物也不适合有卵巢巧克力囊肿的女性食用，比如桂圆、红枣、阿胶、蜂王浆等。

巧克力囊肿治疗，可以采用药物或手术的方法治疗。强调个体化治疗，主张选对药物积极治疗，并结合密切随访复查，注意卵巢囊肿的性质变化，症状轻或无症状的轻微病变患者选用期待疗法。有生育要求的轻度患者明确诊断后先行药物治疗，病情重者行保留生育功能的手术。年轻但无生育要求的重症患者，可行保留卵巢功能手术，并辅以药物治疗，症状及病变均严重的无生育要求患者可以进行根治性手术。手术方法有开腹手术和腹腔镜手术两种。腹腔镜手术是最佳的处理方法，目前以腹腔镜确诊加手术以及药物为内异症治疗金标准。迄今为止，除根治性的手术外，还没有理想的根治方法，无论是药物治疗或保守性的手术治疗，都有相当高的复发率。因此应该根据患者年龄、症状、体征、病变范围以及对生育要求，患者的主观愿望等因素加以选择。