体温35.9℃并伴有头痛，可能是生理性因素导致的，也可能是偏头痛、上呼吸道感染、新型冠状病毒感染等病理性因素导致的，患者明确疼痛原因后，可以选择日常调理、药物治疗改善症状。
一、生理性因素
如果患者过度劳累，夜间睡眠不好，身心压力大，可能会导致体温偏低，伴有头痛症状。建议不要过度劳累，合理安排时间，保证充足的睡眠，通常可以自行恢复。
二、病理性因素
1、偏头痛：偏头痛是一种原发性头痛类型，患者的主要症状就是头痛，通常还会伴随恶心、呕吐等，使体温35.9℃，可能还会出现头痛。如果不是特别严重，通过适当休息可缓解头痛。如果头痛比较剧烈，可以遵医嘱服用吲哚美辛片、尼莫地平片、复方普萘洛尔咖啡因片等药物进行治疗，具有镇痛的作用，可以改善脑部血液循环，缓解症状。
2、急性上呼吸道感染：急性上呼吸道感染大多数由病毒感染引起，患者通常会出现轻度畏寒、头痛，初期可能会导致体温降低，随后便出现发热。患者可以遵医嘱服用复方阿司匹林片、对乙酰氨基酚片、吲哚美辛肠溶片等药物进行治疗，具有解热镇痛的功效。
3、新型冠状病毒感染：与新型冠状病毒有关，病毒侵入后可能会使患者体温降低，有的患者还可能会头疼。患者可以遵医嘱使用、盐酸阿比多尔片、疏风解毒胶囊等药物，具有清热解毒的功效。
如果患者症状比较严重，并伴有其他不适，可以去医院进行血常规、脑电图检查、脑磁共振等检查来明确原因，然后及时治疗。建议患者适当减压，可以通过泡温水浴、做瑜伽等方式缓解头痛，也可也适当锻炼，增强抵抗力。
