对于苦瓜会不会对生育有影响这个问题，研究人员用小白鼠进行实验，发现在孕期早期和中期，β-苦瓜蛋白可以通过一系列的反应抑制孕鼠的子宫蜕膜化和子宫内膜的增殖，这些反应主要有：阻止受精卵继续孵化，减少胚泡的粘附，减少滋养层细胞的向外生长，以及内细胞团的形成等。但α-苦瓜蛋白和β-苦瓜蛋白在怀孕前都不会影响卵泡的形成和成熟。
通过对结果的观察得出，简单地说，苦瓜对怀孕的人有影响(怀孕初期和中期)，吃多了会导致流产，但对未怀孕的人影响较小。
对于男性而言，科学家认为苦瓜蛋白会影响精子的正常发育和活力，但这种影响是可逆的，所以也不会有多大的影响，即当停止吃苦瓜时，生育力又恢复正常。而且，一般人吃饭时吃的苦瓜量也达不到影响生育的程度。也就没多大问题。
科学家们正对苦瓜和不育的关系进行深入研究，但尚未得出终结论。
