生育系统的自身抗原在两性都能激发免疫反应，造成自身免疫性不育，如男性抗精子免疫性不育和女性抗透明带免疫不育。精液抗原也能引起女性的同种抗精子免疫反应，即女性不育。不育的原因是复杂的，导致不育的原因有很多，其中有女方的原因，男方的原因，也有男女双方的原因。要解决不孕不育问题，关键是要明确其病因，只有明确其病因，才能对症治疗。
免疫性不孕是相对的概念，指的是免疫使生育能力下降，造成暂时的不孕。免疫和生育之间的相互作用决定不育状态能否持续，如果免疫强于生育，则出现不孕，而生育强于生育，则出现妊娠。许多因素都会导致不孕，免疫因素也可以作为不孕的唯一原因，或者与其他原因共存。
已婚育龄夫妇在婚后两年未采取避孕措施，婚后无生育能力，有患不育的风险，免疫性不育占20%，其中免疫精子抗体占20%(占60%)，免疫卵巢抗体占20%(约60%)，抗子宫内膜抗体、抗心磷脂抗体、抗卵巢抗体的发病率呈上升趋势。
男性患有尿道炎，前列腺炎，附睾炎，睾丸炎，接受输精管结扎或其他手术后，输精管发生堵塞，外伤，血睾屏障被破坏，精子漏出或巨噬细胞进入生殖道吞噬消化精子细胞，其携带的精子抗原激活免疫系统，引起精子的自身免疫反应，男性产生自己的抗精子抗体。
如果性生活中有子宫内膜炎或生殖道异常，一旦女性对精液抗原产生过敏反应，即使生殖道随后恢复正常时才发生的性行为，也会导致所谓的“二次免疫反应”，使女性体内不断产生抗精子抗体。因此，导致免疫不育。
